for ($i=0;$i<(scalar(@np));$i++) { if ($gap[$index]>=-200) { print OFILE "$coordinate[$index]\t$np[$index]\n"; } else { print OFILE "End of block $index.\n"; print OFILE "$coordinate[$index]\n"; print OFILE "Start of block $index.\n"; } $index++; } #### 4775792 p 4775842 p 4775852 p 4775902 p 4775952 p #### 4775792 p 4775842 p 4775852 p 4775902 p 4775952 p 4776002 n