Amino Acid Switch Probabiities 	   AAA	   AAC	   AAG	   AAT	   ACA	   ACC	   ACG	   ACT	   AGA	   AGC	   AGG	   AGT	   ATA	   ATC	   ATG	   ATT
AAA	0.40849	0.01506	0.26198	0.01904	0.01527	0.0065	0.01149	0.00774	0.09164	0.00886	0.06529	0.01076	0.0066	0.00143	0.00546	0.00199
AAC	0.011	0.41485	0.00959	0.25289	0.00916	0.01865	0.0096	0.01375	0.00594	0.06004	0.00586	0.04124	0.00198	0.00335	0.00212	0.00227
AAG	0.29591	0.01484	0.46315	0.01686	0.01135	0.00675	0.01565	0.00657	0.06807	0.00889	0.09736	0.00994	0.00415	0.00151	0.00852	0.00177
AAT	0.0123	0.22372	0.00965	0.3545	0.00971	0.01103	0.00955	0.01893	0.00611	0.03574	0.00553	0.06048	0.00225	0.00204	0.00231	0.00365
ACA	0.00913	0.0075	0.006	0.00899	0.25029	0.13459	0.19326	0.15274	0.00817	0.0142	0.00526	0.01523	0.01986	0.00584	0.01536	0.00737
ACC	0.00368	0.01445	0.00338	0.00966	0.12735	0.27128	0.15326	0.14524	0.00311	0.02754	0.00306	0.01691	0.00817	0.01213	0.00809	0.00755
ACG	0.0024	0.00274	0.00289	0.00309	0.06746	0.05654	0.0985	0.05631	0.0019	0.00596	0.00256	0.00568	0.00401	0.00227	0.00719	0.00266
ACT	0.00395	0.0096	0.00296	0.01494	0.13029	0.13094	0.1376	0.2089	0.00312	0.01788	0.00272	0.02573	0.00854	0.00653	0.00841	0.01267
AGA	0.04383	0.00389	0.02882	0.00452	0.00654	0.00263	0.00435	0.00293	0.28665	0.00702	0.17898	0.00863	0.00367	0.00076	0.00259	0.00093
AGC	0.00598	0.05551	0.00531	0.03735	0.01604	0.03288	0.01929	0.02368	0.00991	0.3642	0.01051	0.23871	0.00275	0.00449	0.0028	0.00327
AGG	0.0274	0.00337	0.03617	0.00359	0.00369	0.00227	0.00515	0.00224	0.15703	0.00653	0.25775	0.00725	0.00203	0.00066	0.00346	0.00076
AGT	0.00519	0.02725	0.00425	0.04518	0.0123	0.01443	0.01315	0.02436	0.00871	0.17062	0.00833	0.28774	0.00236	0.0019	0.00217	0.00399
ATA	0.00219	0.0009	0.00122	0.00115	0.01102	0.00479	0.00637	0.00556	0.00254	0.00135	0.0016	0.00162	0.19608	0.0846	0.02113	0.08774
ATC	0.00101	0.00324	0.00095	0.00224	0.00691	0.01517	0.0077	0.00905	0.00112	0.0047	0.00111	0.00279	0.18032	0.36846	0.02111	0.22364
ATG	0.00423	0.00224	0.00584	0.00277	0.01992	0.01108	0.02671	0.01278	0.00419	0.00321	0.00639	0.00348	0.04935	0.02313	0.58867	0.0273
ATT	0.00123	0.00193	0.00097	0.0035	0.00763	0.00826	0.00788	0.01538	0.0012	0.003	0.00113	0.00512	0.16368	0.19576	0.02181	0.31668