static Func_t initFuncs[] = { Foo_Init, Bar_Init, Baz_Init, ... };
static Func_t runFuncs[] = { Foo_Run, Bar_Run, Baz_Run, ... };

int main(void)
{
    SystemInit(); // from Atmel
    for (size_t i=0; i<ARRAY_SIZE(initFunc); i++) {
        initFuncs[i]();
    }
    for (;;) {
        for (size_t i=0; i<ARRAY_SIZE(runFunc); i++) {
            runFuncs[i]();
        }
    }
}