ken@titan ~/tmp
$ ./pm_11146491_sort_matrix.pl
Original
t1 t1 t2 t2 t1 t2
a1 a2 a1 a2 a3 a3
mis mis mis mis del del
Sorted indices
0 1 4 2 3 5

ken@titan ~/tmp
$ ./pm_11146491_sort_matrix.pl
Original
t1 t1 t2 t2 t1 t2
a1 a2 a3 a2 a3 a1
mis mis mis mis del del
Sorted indices
0 1 4 5 3 2

ken@titan ~/tmp
$ ./pm_11146491_sort_matrix.pl
Original
t1 t1 t2 t2 t1 t2
a2 a1 a3 a2 a3 a1
mis mis mis mis del del
Sorted indices
1 0 4 5 3 2