use Benchmark qw/cmpthese/; my $line = 'rs11502186 C/G Chr11 170472 + ncbi_b34 perlegen urn:lsid:perlegen.hapmap.org:Protocol:Genotyping_1.0.0:2 urn:lsid:perlegen.hapmap.org:Assay:25763.7541533:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ GG GG GG NN GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG NN GG GG GG NN GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG NN GG GG GG GG NN GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG GG'; cmpthese(-1, { 'Greedy' => sub {$line =~ /(chr.*?)\s.*urn:lsid:(.*?)\s.*panel:(.*?):/i}, 'Non' => sub {$line =~ /(chr.*?)\s.*?urn:lsid:(.*?)\s.*?panel:(.*?):/i}, 'Sep' => sub {$line =~ /(chr.*?)\s/i; $line =~ /urn:lsid:(.*?)\s/i; $line =~ /panel:(.*?):/i; }, 'Death_star' => sub {$line =~ /(chr[^\s]+)/i; $line =~ /urn:lsid:([^\s]+)/i; $line =~ /panel:([^:]+)/i; } } ); #### Rate Greedy Sep Non Death_star Greedy 8650/s -- -95% -95% -97% Sep 157827/s 1725% -- -6% -41% Non 167020/s 1831% 6% -- -38% Death_star 267963/s 2998% 70% 60% --