my @inst = ( 'GGTGTGCC', 'GCTGTGGG', 'GGTGGGCC' ); #### T => 0 0 1 0 0.666666666666667 0 0 0 C => 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0.666666666666667 0.666666666666667 G => 1 0.666666666666667 0 1 0.333333333333333 1 0.333333333333333 0.333333333333333 #### A => 0 0 0 0 0 0 0 0