Name Pos gc score present_absent CLS_S3_Contig1000 1 0 . . . . . . . . . . . . CLS_S3_Contig1000 67 0 CLS_S3_Contig1000 68 0 CLS_S3_Contig1000 69 0 CLS_S3_Contig1000 70 0 CLS_S3_Contig1000 71 0 CLS_S3_Contig1000 72 0 CLS_S3_Contig1000 73 0 CLS_S3_Contig1000 74 0 CLS_S3_Contig1000 75 0 CLS_S3_Contig1000 76 0 CLS_S3_Contig1000 77 9 0.4324 1 CLS_S3_Contig1000 78 0 CLS_S3_Contig1000 79 8 0.3904 1 CLS_S3_Contig1000 80 0 CLS_S3_Contig1000 81 9 0.452 1 CLS_S3_Contig1000 82 0 CLS_S3_Contig1000 83 11 0.4807 1 CLS_S3_Contig1000 84 0 CLS_S3_Contig1000 85 10 0.4892 1 CLS_S3_Contig1000 86 0 CLS_S3_Contig1000 87 10 0.5234 1 CLS_S3_Contig1000 88 0 CLS_S3_Contig1000 89 11 0.5374 1 CLS_S3_Contig1000 90 0 CLS_S3_Contig1000 91 10 0.5249 1 CLS_S3_Contig1000 92 0 CLS_S3_Contig1000 93 11 0.5553 1
#The name is changing here and it will change over and over
CLS_S3_Contig10007 1 0
. . .
. . .
. . .
. . .
CLS_S3_Contig10007 43 0
CLS_S3_Contig10007 44 0
CLS_S3_Contig10007 45 0
CLS_S3_Contig10007 46 0
CLS_S3_Contig10007 47 0
CLS_S3_Contig10007 48 0
CLS_S3_Contig10007 49 0
CLS_S3_Contig10007 50 0
CLS_S3_Contig10007 51 0
CLS_S3_Contig10007 52 0
CLS_S3_Contig10007 53 10 0.4316 1
CLS_S3_Contig10007 54 0
CLS_S3_Contig10007 55 12 0.5951 1
CLS_S3_Contig10007 56 0
CLS_S3_Contig10007 57 0
CLS_S3_Contig10007 58 0
CLS_S3_Contig10007 59 12 0.5825 1
CLS_S3_Contig10007 60 0
CLS_S3_Contig10007 61 12 0.4785 1
CLS_S3_Contig10007 62 0
CLS_S3_Contig10007 63 14 0.566 1
CLS_S3_Contig10007 64 0
CLS_S3_Contig10007 65 14 0.4894 1
CLS_S3_Contig10007 66 0
CLS_S3_Contig10007 67 15 0.4756 1
CLS_S3_Contig10007 68 0
####
Name Pos gc score present_absent
CLS_S3_Contig1000 1 0
. . .
. . .
. . .
. . .
CLS_S3_Contig1000 67 0
CLS_S3_Contig1000 68 0
CLS_S3_Contig1000 69 1
CLS_S3_Contig1000 70 1
CLS_S3_Contig1000 71 1
CLS_S3_Contig1000 72 1
CLS_S3_Contig1000 73 1
CLS_S3_Contig1000 74 1
CLS_S3_Contig1000 75 1
CLS_S3_Contig1000 76 1
CLS_S3_Contig1000 77 9 0.4324 1
CLS_S3_Contig1000 78 1
CLS_S3_Contig1000 79 8 0.3904 1
CLS_S3_Contig1000 80 1
CLS_S3_Contig1000 81 9 0.452 1
CLS_S3_Contig1000 82 1
CLS_S3_Contig1000 83 11 0.4807 1
CLS_S3_Contig1000 84 1
CLS_S3_Contig1000 85 10 0.4892 1
CLS_S3_Contig1000 86 1
CLS_S3_Contig1000 87 10 0.5234 1
CLS_S3_Contig1000 88 1
CLS_S3_Contig1000 89 11 0.5374 1
CLS_S3_Contig1000 90 1
CLS_S3_Contig1000 91 10 0.5249 1
CLS_S3_Contig1000 92 1
CLS_S3_Contig1000 93 11 0.5553 1
#The name is changing here and it will change over and over
CLS_S3_Contig10007 1 0
. . .
. . .
. . .
. . .
CLS_S3_Contig10007 42 0
CLS_S3_Contig10007 43 0
CLS_S3_Contig10007 44 0
CLS_S3_Contig10007 45 1
CLS_S3_Contig10007 46 1
CLS_S3_Contig10007 47 1
CLS_S3_Contig10007 48 1
CLS_S3_Contig10007 49 1
CLS_S3_Contig10007 50 1
CLS_S3_Contig10007 51 1
CLS_S3_Contig10007 52 1
CLS_S3_Contig10007 53 10 0.4316 1
CLS_S3_Contig10007 54 1
CLS_S3_Contig10007 55 12 0.5951 1
CLS_S3_Contig10007 56 1
CLS_S3_Contig10007 57 1
CLS_S3_Contig10007 58 1
CLS_S3_Contig10007 59 12 0.5825 1
CLS_S3_Contig10007 60 1
CLS_S3_Contig10007 61 12 0.4785 1
CLS_S3_Contig10007 62 1
CLS_S3_Contig10007 63 14 0.566 1
CLS_S3_Contig10007 64 1
CLS_S3_Contig10007 65 14 0.4894 1
CLS_S3_Contig10007 66 1
CLS_S3_Contig10007 67 15 0.4756 1
CLS_S3_Contig10007 68 1