Name Pos gc score present_absent CLS_S3_Contig1000 1 0 . . . . . . . . . . . . CLS_S3_Contig1000 67 0 CLS_S3_Contig1000 68 0 CLS_S3_Contig1000 69 0 CLS_S3_Contig1000 70 0 CLS_S3_Contig1000 71 0 CLS_S3_Contig1000 72 0 CLS_S3_Contig1000 73 0 CLS_S3_Contig1000 74 0 CLS_S3_Contig1000 75 0 CLS_S3_Contig1000 76 0 CLS_S3_Contig1000 77 9 0.4324 1 CLS_S3_Contig1000 78 0 CLS_S3_Contig1000 79 8 0.3904 1 CLS_S3_Contig1000 80 0 CLS_S3_Contig1000 81 9 0.452 1 CLS_S3_Contig1000 82 0 CLS_S3_Contig1000 83 11 0.4807 1 CLS_S3_Contig1000 84 0 CLS_S3_Contig1000 85 10 0.4892 1 CLS_S3_Contig1000 86 0 CLS_S3_Contig1000 87 10 0.5234 1 CLS_S3_Contig1000 88 0 CLS_S3_Contig1000 89 11 0.5374 1 CLS_S3_Contig1000 90 0 CLS_S3_Contig1000 91 10 0.5249 1 CLS_S3_Contig1000 92 0 CLS_S3_Contig1000 93 11 0.5553 1

#The name is changing here and it will change over and over

CLS_S3_Contig10007 1 0 . . . . . . . . . . . . CLS_S3_Contig10007 43 0 CLS_S3_Contig10007 44 0 CLS_S3_Contig10007 45 0 CLS_S3_Contig10007 46 0 CLS_S3_Contig10007 47 0 CLS_S3_Contig10007 48 0 CLS_S3_Contig10007 49 0 CLS_S3_Contig10007 50 0 CLS_S3_Contig10007 51 0 CLS_S3_Contig10007 52 0 CLS_S3_Contig10007 53 10 0.4316 1 CLS_S3_Contig10007 54 0 CLS_S3_Contig10007 55 12 0.5951 1 CLS_S3_Contig10007 56 0 CLS_S3_Contig10007 57 0 CLS_S3_Contig10007 58 0 CLS_S3_Contig10007 59 12 0.5825 1 CLS_S3_Contig10007 60 0 CLS_S3_Contig10007 61 12 0.4785 1 CLS_S3_Contig10007 62 0 CLS_S3_Contig10007 63 14 0.566 1 CLS_S3_Contig10007 64 0 CLS_S3_Contig10007 65 14 0.4894 1 CLS_S3_Contig10007 66 0 CLS_S3_Contig10007 67 15 0.4756 1 CLS_S3_Contig10007 68 0