GeneX,GeneY,GeneP,spc1,spc2 
GeneY,spc3,spc4 
GeneZ,spc3,spc4 

##</code><code>##

Desired Result 
GeneX,GeneY,GeneP,GeneZ,spc1=1,spc2=1,spc3=2,spc4=2